越来越多的人注意到，现代农业在给人类带来高效劳动生产率和丰富物质产品的同时，也造成了生态危机：土壤侵蚀、化肥和农药用量上升、能源危机加剧、环境污染。面对以上问题，各国开始探索农业发展的新途径和新模式。由此提出生态农业这个概念。
生态农业更多的是用来解决农业和农产品安全问题的。中国生态农业的基本内涵是：按照生态学原理和经济学原理，运用现代科学技术成果和现代管理手段，以及传统农业的有效经验建立起来的，能获得较高的经济效益、生态效益和社会效益的现代化高效农业。它要求把发展粮食与多种经济作物生产，发展大田种植与林、牧、副、渔业，发展大农业与第二、三产业结合起来，利用传统农业精华和现代科技成果，通过人工设计生态工程、协调发展与环境之间、资源利用与保护之间的矛盾，形成生态上与经济上两个良性循环，经济、生态、社会三大效益的统一。
“中国生态农业”与西方那种完全回归自然、摒弃现代投入的“生态农业”主张完全不同。它强调的是继承中国传统农业的精华--废弃物质循环利用; 规避常规现代农业的弊病(单一连作,大量使用化肥、农药等化学品,大量使用化石能源等);通过用系统学和生态学规律指导农业和农业ECO结构的调整与优化(如推行立体种植, 病虫害生物防治),改善其功能; 以及推进农户庭院经济等。
常见的生态农业模式有稻田养鱼养萍、粮桑渔结合、种养加结合等复合ECO模式；鸡粪喂猪、猪粪喂鱼等有机废物多级综合利用的模式。比如江西近年大力推广的“稻虾、稻鱼、稻鳖、稻蛙、稻鳅和稻蟹”六大种养模式，可帮助农民亩均增收1600元以上，是单一种植水稻收益的3-6倍。同时，改善了生态环境，每亩可减少化肥施用量30%以上、农药施用量40%以上，实现了“一水两用、一田双收、稳粮增渔、粮渔双赢”的良好经济和生态效益。
生态农业的特点在于，其生产以资源的永续利用和生态环境保护为重要前提，根据生物与环境相适应、物种优化组合、能量物质高效运转、输入输出平衡等原理，充分的发挥资源潜力和物种多样性优势，建立良性物质循环体系，实现经济、社会、生态效益的统一。高效生态农业具有其它农业模式所不具备的下述五大优势：
安全是指食物安全与国家安全。食物安全又包括食物的数量安全与质量安全，也就是说能够吃的饱、吃得好，在源头杜绝重大疾病发生。其次是国家安全，高效生态农业能够生产出足够多的食物满足国内需求，不会向敌对国进口粮食，也不会用国外发明的转基因这种“卡脖子”的技术。
因为在源头就不用农药、化肥、地膜这些有害化学物质，农田生态系统率先恢复健康，水体中不会进入氮磷等营养物质，可降解有机物进入土壤而不是进入水体分解，分解后作为优质有机肥养地。
就是全民大健康。全民免疫力得到大幅度提升，一些小病小灾，基本上不出村或不出社区，依靠增强的免疫力加上传统中医就能抵抗过去如感冒等。即使有了一些疾病，由于发展了医用中草药，不用农药、化肥、地膜、激素生产的优质的中草药，对治疗疾病发挥的作用更大。
目前农村人口将占据了全国的一半以上，而这一半人口往往是目前是收入比较低下的，被迫进城打工。发展高效生态农业后，要求农民在家门口就业，这个就业不光是单一的种植，而是包括种植、养殖、加工、销售与生态旅游，即“种、养、加、销、游”高效生态农业产业体系“五位一体”。草原上的牧民、林区的工人和海边、湖边的渔民也一样，他们的就业是多样化的。
由于贫困的人口变成了中产阶级，变成了工薪阶层，懒人变少；农牧民吃不完的优质食物以优价销售给城市富裕人群，现金流从城市逆流到乡村或牧区，农民腰包鼓了，就会消费工业品，他们在家门口就业，住别墅，吃有机食品，开轿车进城。这样，农民在保护家园、保护生态环境、保护生物多样性基础上，实现产业脱贫，就地脱贫，实现共同富裕
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